Заказчик отклонил мою заявку из-за того, что я не подтвердил страну происхождения товара, но при этом принял заявку другого участника, где тоже был товар иностранного происхождения. Это правомерно?

Нет, это неправомерно. Комиссия по осуществлению закупок обязана последовательно применять требования к заявкам, установленные в извещении об осуществлении закупки, в том числе касающиеся подтверждения страны происхождения товара и ограничений закупок товаров, происходящих из иностранных государств. Если заявка участника отклоняется по основанию отсутствия информации, подтверждающей страну происхождения товара (что приравнивает его к иностранному), при наличии соответствующей заявки с российским товаром, то признание соответствующей другой заявки, содержащей предложение о поставке товара иностранного происхождения, является нарушением требований Закона о контрактной системе.